举例说明微生物在自然界物质循环中的作用以氮素循环为例：微生物在氮素循环过程中主要环节中的作用

（1）大气分子态氮被固定成氨（固氮作用），例如根瘤菌和豆科植物根的共生体的固氮作用，以便形成有机氮。
（2）氨被植物吸收利用，合成有机氮进入食物链（同化作用），例如外生菌根扩大了植物根系的吸收面积，利于氨和其他养分的吸收。
（3）有机氮被分解释放出氨（氨化作用），例如好热性放线菌在堆肥的高温阶段将蛋白质氨化；尿素细菌水解尿素产生氨；嗜几丁质杆菌分解几丁质并产氨
（4）氨被转化为硝酸（硝化作用）又可被同化为有机氮，例如硝化细菌中的亚硝酸细菌推动氨转化为亚硝酸，硝酸细菌的亚硝酸氧化酶系统催化亚硝基氧化为硝基。
（5）硝酸被还原为分子态氮返回大气（反硝化作用），例如假单孢菌在低浓度的KNO3条件下的反硝化作用占优势，而KNO3浓度高时，芽孢杆菌则占优势。