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genbank序列格式

提问人:网友wu24wu24 发布时间:2022-01-06
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第1题
简要介绍GenBank中的DNA序列格式。
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第2题
GenBank中FASTA格式仅记录了核酸的序列
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第3题
仔细阅读所查询核酸序列GENBANK和EBI序列格式的解释,理解各字段的含义,并比较GENBANK与EBI序列格式的异同。
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第4题
以下关于GenBank数据格式的描述,错误的是:

A.GenBank格式的记录中,包含了众多相关数据库的超链接

B.GenBank格式的记录最后通常都是以双斜杠代表序列信息的终止

C.GenBank格式的记录首行以”>“开始

D.GenBank格式的记录提供序列的文献信息,其文献数据库为PUBMED

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第5题
以下哪些属于GenBank格式序列的Field?

A.LOCUS

B.COMMENT

C.VERSION

D.GENE NAME

E.TITLE

F.FEATURES

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第6题
以下关于GenBank数据格式的描述,错误的是:

A.GenBank格式的记录中,包含了众多相关数据库的超链接

B.GenBank格式的记录 最后通常都是以双斜杠代表序列信息的终止

C.GenBank格式的记录首行以”>“开始

D.GenBank格式的记录提供序列的文献信息,其文献数据库为PUBMED

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第7题
以下这条序列是什么格式? >NP_000509.1 hemoglobin subunit beta [Homo sapiens] MVHLTPEEKSA
VTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLG AFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVAN ALAHKYH

A、GenBank

B、GenPept

C、FASTA

D、HTML

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第8题
在Genbank中使用的序列文件格式为()是一种最简单的格式,第一行以“>”表示一个先序列的开始

A.FASTA

B.GBFF

C.BLAST

D.ORIGIN

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第9题
《生物信息学》是一门理论性和实践性都很强的课程。为了更好地提升学习者的生物信息学分析技能,本课
程共布置6次作业。 希望每位学习者自开课之初都选择唯一的一条核酸序列进行全程分析,要求该序列为具有完整编码区(CDS)的mRNA序列,含有5’-UTR、CDS及3’-UTR。 每人1题分析自己选择的核酸序列,如提交的作业分析的序列与自己选择的序列不相符合,该次作业按0分处理。 请选择好序列后,在讨论区接龙提交个人信息及待分析的核酸序列的序列号。然后再下载该序列的GenBank格式文档。

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第10题
根据第5次作业,第一大题第4小题结果(已知番茄 TTG1-like 蛋白的登录号为 XP_004235332.1,选取 Re
1. 根据第5次作业,第一大题第4小题结果(已知番茄 TTG1-like 蛋白的登录号为 XP_004235332.1,选取 Reference proteins 数据库,搜索并下载该蛋白质在10个以上物种 RefSeq 数据库中的同源序列,建立FAST格式的文本文档),利用 Mega6.06软件构建进化树(进化树上只显示登录号和物种名)。 2. 已知某EST的GenBank Accession为CK266615.1,请分析: (1) 该EST最可能来自于哪个基因? (2) 获取该基因所编码的蛋白质序列; (3)搜索并下载该蛋白质在拟南芥、水稻、人类、酵母、大肠杆菌等10个物种RefSeq数据库中的同源序列; (4)构建进化树(进化树上只显示登录号和物种名) 要求:1. 提交的文件格式为word。 2. 上传构建系统进化树分析的全部蛋白质fasta格式序列的TXT文档,每条序列以“登录号+物种名(拉丁文)”命名。 3. 关键的步骤请截图粘贴至Word文档中,并用文字简要说明你的分析过程和结论。

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